POS机手续费一般会在用户刷卡消费的时候从商户的卡里扣除。不同商户的经营范围决定了扣除的数量。POS机的手续费不会从消费者的卡里扣取，是按照交易量的百分比来扣除的。就像我们日常的刷卡消费，商家是要承担一定的交易手续费的。
一、POS机手续费扣取方式
只要POS机产生交易，商家都是要被扣除手续费的。国家标准的费率值是0.6%，扫码费率是0.38%。例如消费者刷卡10000元，就要扣除商家60元的手续费，实际到账也就是10000-60=9940元。假如是扫码1000元，需扣除商家3.8元的费率，实际到账1000-3.8=996.2元。
二、POS机手续费的承担方
1、正常情况下手续费是在消费者交易后自动在商户的卡里扣除的，要商家自行承担。由发卡行、银联、收单公司共同来分配这笔手续费，分配比例是70%、10%、20%。
2、不同行业的手续费收取标准是不同的，但是全国有统一的收费标准。使用标准费率的POS机一般都足以证明这是一台正规的一清POS机。
POS机之所以要收取一定的手续费是因为刷卡交易的资金都是通过银联的渠道来结算的，银联和银行收单公司都在其中充当了重要的作用。所以这三者赚其中的手续费同样是可以理解的。
